乔纳坦作为印尼主力出战2017年东南亚运动会羽毛球竞赛。在半决赛，印尼队以3比0打败泰国国家羽毛球队。决赛中，协助印尼队以总比分3-0筛选了马来西亚国家羽毛球队，夺得集体赛金牌；而在个人赛事中，乔纳坦在决赛中以2比0（21-19、21-10）轻取泰国的科希特，成为了本届竞赛的双冠王。

　　2018年8月23日，2018年雅加达亚运会羽毛球男人集体决赛的抢夺，由安东尼·西尼苏卡·金廷、苏卡穆约、马库斯·费尔纳迪·吉迪恩、乔纳坦、阿尔弗兰·埃科·普拉塞特亚、阿德里安托组成的印尼男队1-3不敌我国男队，取得亚军。

　　2024年3月17日全英公开赛男单决赛，乔纳坦21-15, 21-14打败金廷，在阅历4连败后取得胜利，夺得首座超级1000冠军，也是职业生涯第7个羽联巡回赛男单冠军，这也是印尼羽毛球队继阿尔比之后时隔三十年再度登顶全英。